Во второй камере стоки снова отстаиваются, здесь вторично осуществляется разделение тех взвешенных частиц, которые не задержались в первой камере и на биофильтре.
В некоторых септиках стоки из второй камеры могут попасть на следующий анаэробный биофильтр, где будет совершаться вторичное разложение органики.
Так как бактерии разлагают биологические вещества, то при прохождении биофильтра стоки очищаются.
Можно установить сменный биофильтр, который обеспечивает очистку струи воды.