Между эпителиальными клетками имеются микроскопические щели, создающие благоприятные условия для перехода первичной мочи из чаши капсулы в мочевой каналец.
До впадения в слезный мешок канальцы соединяются в одно устье, реже (в 10 % случаев) каждый каналец впадает непосредственно в слезный мешок.
Под микроскопом можно увидеть клубочки, от которых отходит сильно извитой каналец (проксимальный), петельки, имеющие соответственно нисходящее и восходящее колена (петля Генле), затем снова вьется каналец, пока не попадет в прямую трубочку (собирательную трубку).
Последний представляет собой тоненький каналец, который, начавшись от места слияния ductus deferens и ductus excretorius, проходит через толщу предстательной железы и открывается в предстательную часть мочеиспускательного канала узким отверстием у основания семенного бугорка.