Это исключение объясняется тем, что основным (непроизводным) глаголом в этом семействе родственных слов является глагол плыть(а не плавать), на которое и ориентируется написание двух слов-исключений (плыть – пловец, пловчиха, ударная перегласовка Ы/О)